Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf4Q60722 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms