Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms