Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prdm1Q60636 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms