Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms