Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms