Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms