Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc85aQ5SP85 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85aQ5SP85 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms