Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH6

Smg7, Protein SMG7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg7Q5RJH6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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