Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1F6

Trav5d-4, T cell receptor alpha variable 5D-4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav5d-4Q5R1F6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav5d-4Q5R1F6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trav5d-4Q5R1F6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav5d-4Q5R1F6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms