Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12253Q5NC48 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms