Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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Nlrc3Q5DU56 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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Nlrc3Q5DU56 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Nlrc3Q5DU56 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Nlrc3Q5DU56 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Nlrc3Q5DU56 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Nlrc3Q5DU56 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms