Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spag9Q58A65 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spag9Q58A65 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms