Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Urb1Q571H0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Urb1Q571H0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Urb1Q571H0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Urb1Q571H0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urb1Q571H0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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