Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms