Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp48Q3V0C5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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Usp48Q3V0C5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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Usp48Q3V0C5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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Usp48Q3V0C5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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Usp48Q3V0C5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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Usp48Q3V0C5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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Usp48Q3V0C5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Usp48Q3V0C5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Usp48Q3V0C5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Usp48Q3V0C5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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