Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0B4

Cfap65, Cilia- and flagella-associated protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 1,847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap65Q3V0B4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap65Q3V0B4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap65Q3V0B4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms