Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm5aQ3UXZ9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms