Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms