Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cep63Q3UPP8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms