Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BtrcQ3ULA2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BtrcQ3ULA2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms