Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf224Q3UIW8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf224Q3UIW8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms