Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Otud5Q3U2S4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Otud5Q3U2S4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Otud5Q3U2S4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Otud5Q3U2S4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Otud5Q3U2S4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Otud5Q3U2S4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Otud5Q3U2S4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Otud5Q3U2S4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Otud5Q3U2S4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Otud5Q3U2S4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Otud5Q3U2S4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Otud5Q3U2S4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Otud5Q3U2S4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Otud5Q3U2S4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Otud5Q3U2S4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms