Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc28Q3TX51 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms