Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Srsf6Q3TWW8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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