Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cwc27Q3TKY6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms