Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gtf2f1Q3THK3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2f1Q3THK3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms