Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax1Q2NKI2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms