Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1aQ2LKU9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1aQ2LKU9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1aQ2LKU9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1aQ2LKU9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1aQ2LKU9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1aQ2LKU9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1aQ2LKU9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1aQ2LKU9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1aQ2LKU9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nlrp1aQ2LKU9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nlrp1aQ2LKU9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nlrp1aQ2LKU9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms