Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Shroom4Q1W617 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Shroom4Q1W617 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Shroom4Q1W617 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Shroom4Q1W617 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Shroom4Q1W617 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shroom4Q1W617 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shroom4Q1W617 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shroom4Q1W617 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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Shroom4Q1W617 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shroom4Q1W617 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Shroom4Q1W617 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shroom4Q1W617 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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Shroom4Q1W617 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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