Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sap25Q1EHW4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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