Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam171bQ14CH0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Fam171bQ14CH0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam171bQ14CH0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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