Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms