Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms