Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne7Q0VE82 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms