Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrriq1Q0P5X1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
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