Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubxn2bQ0KL01 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms