Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf541Q0GGX2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf541Q0GGX2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms