Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chd8Q09XV5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chd8Q09XV5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chd8Q09XV5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chd8Q09XV5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Chd8Q09XV5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chd8Q09XV5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chd8Q09XV5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Chd8Q09XV5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chd8Q09XV5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chd8Q09XV5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chd8Q09XV5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chd8Q09XV5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chd8Q09XV5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms