Protein–RNA interactions for Protein: Q08297

Rad51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51Q08297 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rad51Q08297 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51Q08297 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms