Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms