Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a2Q07643 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms