Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bp2Q06649 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms