Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx2Q06348 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms