Protein–RNA interactions for Protein: Q05BQ1

Igsf9, Protein turtle homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9Q05BQ1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf9Q05BQ1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms