Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tff2Q03404 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms