Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms