Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha4Q03137 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha4Q03137 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms