Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms