Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GscQ02591 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GscQ02591 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GscQ02591 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GscQ02591 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GscQ02591 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GscQ02591 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GscQ02591 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GscQ02591 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GscQ02591 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GscQ02591 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GscQ02591 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GscQ02591 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GscQ02591 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GscQ02591 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GscQ02591 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GscQ02591 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GscQ02591 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GscQ02591 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GscQ02591 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GscQ02591 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GscQ02591 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GscQ02591 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GscQ02591 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GscQ02591 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GscQ02591 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GscQ02591 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GscQ02591 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GscQ02591 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GscQ02591 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GscQ02591 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GscQ02591 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GscQ02591 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GscQ02591 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GscQ02591 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GscQ02591 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GscQ02591 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GscQ02591 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GscQ02591 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GscQ02591 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GscQ02591 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GscQ02591 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GscQ02591 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GscQ02591 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GscQ02591 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GscQ02591 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GscQ02591 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GscQ02591 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GscQ02591 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GscQ02591 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GscQ02591 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GscQ02591 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GscQ02591 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GscQ02591 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GscQ02591 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GscQ02591 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GscQ02591 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GscQ02591 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GscQ02591 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GscQ02591 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GscQ02591 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GscQ02591 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GscQ02591 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GscQ02591 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GscQ02591 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GscQ02591 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GscQ02591 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GscQ02591 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GscQ02591 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GscQ02591 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GscQ02591 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GscQ02591 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GscQ02591 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GscQ02591 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GscQ02591 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GscQ02591 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GscQ02591 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GscQ02591 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GscQ02591 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GscQ02591 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GscQ02591 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GscQ02591 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GscQ02591 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GscQ02591 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GscQ02591 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GscQ02591 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GscQ02591 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GscQ02591 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GscQ02591 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms