Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcqQ02111 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcqQ02111 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms